Целью школы-конференции является обсуждение условий развития в России такой научной области, как синтетическая биология.
В рамках работы школы-конференции будут затронуты следующие вопросы:
- Совершенствование инженерной биологии для проектирования живых машин
- Проектирование функционала промышленных микроорганизмов с использованием комплекса программного обеспечения университетов США и Европы.
- Высокопроизводительное моделирование компонентов промышленной биосистемы
- Испытания и отладка характеристик спроектированного кода в виртуальной среде
- Синтез и трансфекция разработанного генома в модельный микроорганизм
Важной задачей подведения итогов мероприятия будет обсуждения новых мировых научных вызовов и потребностей российских исследователей в новых актуальных знаниях по инженерному подходу в биологии.
Калифорнийская серия книг по синтетической биологии
Каталог современной фундаментальной литературы – серии из 35 книг, изданных в США в 2009-2012 гг. по прикладным аспектам новейшей области науки и технологии, включающий в себя следующие направления:
- инженерная биология
- микробиоробототехника
- белковый инжиниринг
- синтетическая эпигенетика
- и др.
На данный момент в каталог включены книги серии Methods in ENZYMOLOGY, книги выпущенные сотрудниками MIT, Беркли и Стенфорда, либо в соавторстве с ними. Также рекомендовано включить в состав книги сборник бизнес-кейсов Гарвардской школы бизнеса по новому биотехнологическому бизнесу.
В каталоге приведено обзорное содержание по каждой книге, которые еще ждут своего перевода на русский язык.
Образовательные программы синтетической биологии
Сборник программ образовательных курсов по синтетической биологии в университетах США и Европы: программы Массачусетского технологического института, Университета Беркли, Стэнфорда и многих других университетов. По каждому курсу приводится описание целей и задач, программа и структура, а также обзорное содержание лекций, семинаров и лабораторных работ.
В сборник вошли программы:
- Гарвардского университета (Системная биология 204: Биомолекулярная инженерия и синтетическая биология; Биофизика 242r: Биологические аспекты молекулярной инженерии),
- Массачусетского технологического института (SEED – дополнительная программа для средней школы; 20.20. Введение в биоинженерное проектирование; 20,109/BE.109. Лабораторные основы биоинженерии; BE.180. Биоинженерное программирование; Синтетическая биология),
- Калифорнийского университета Беркли (SB.001. Лабораторные основы синтетической биологии; SB.002. Значение и практическое применение синтетической биологии; SB.003. IGEM; SB.004. Биологическая безопасность и синтетическая биология; SB.005. Синтетическая биология: приложения к человеку (в разработке)),
- Лос-Аламосской национальной лаборатории (Q-bio. Летняя школа по обработке клеточной информации),
- Университета Браун (Bio193. Синтетические биологические системы),
- Genopole (Магистр системной и синтетической биологии (mSSB)),
- Королевского колледжа Лондона (Введение в синтетическую биологию).
Лаборатория синтетической биологии: оборудование и процессы
В настоящее время в университетах и научных центрах мира создано огромное разнообразие специализированных биологических лабораторий, ориентированных на проведение исследований в области протеомики, генетики растений, рака, а также крупных научных центров по междисциплираным направлениям биологии. Как правило, исследователи синтетической биологии используют имеющуюся в таких подразделениях инфраструктуру, используют коллаборацию, аутсорсинг и т.д.
Настоящая брошюра призвана помочь создателям специализированных лабораторий проектирования и реализации искусственных форм жизни – от прокариот до многоклеточных организмов.
Специализированное оборудование разбито на очереди, с каждым шагом усложняющие возможные работы в стенах такой лаборатории. Например «очередь 1» - простейшая лаборатория или студенческое КБ в стенах университета, совокупность «очереди 1-2-3» - современная лаборатория в области генной инженерии, «очереди 1-2-3-4-5-6-7» - технологически совершенная лаборатория по состоянию на 2012 год.
Синтетическая биология в лицах
Ведущие ученые и подвижники в новой области, коллективы и задачи современных лабораторий, их краткий обзор публикаций и научных исследований в 2009-2012 гг.: Charles R. Cantor (Boston University), Christina D. Smolke (Stanford University), Drew Endy (Stanford University), Frances H. Arnold (California Institute of Technology), George M. Church (Harvard Medical School), Hamilton O. Smith (J. Craig Venter Institute), James J. Collins (Boston University), Jay D. Keasling (University of California, Berkeley), Jef D. Boeke (Johns Hopkins University), John Craig Venter (J. Craig Venter Institute), Martin Fussenegger (ETH Zürich), Michael B. Elowitz (California Institute of Technology), Pamela Silver (Harvard Medical School), Ron Weiss (MIT), Stanislas Leibler (Rockefeller University), etc.
Прикладные программы национальных институтов и лабораторий в области биотоплива, продуктов питания и здоровья: Paul Adams (Lawrence Berkeley National Laboratory), Nathan Hillson (LBNL), etc.
Государственные руководители и координаторы прикладных программ и проектов в США и Европе: Alicia Jackson (DARPA), Edward You (FBI), etc.
